Основным направлением деятельности института является проектирование метрополитенов. По проектам института "Ленметрогипротранс" построены все станции метрополитена в Санкт-Петербурге. Эксплуатационная длина линий петербургского метрополитена на 1 января 2008г. составляла 105,6 км. На ветках метро сейчас расположено 60 станций и 6 депо.
Помимо объектов Петербурского метрополитена построена линия Новосибирского и Казанского метрополитена, проектируются и строятся линии метрополитенов в Самаре, Красноярске, Челябенске.
По проектам института ОАО "Ленметрогипротранс" и с его участием построены и строятся автодорожные и железнодорожные тоннели общей протяженностью около 150 км.